Институт является научным учреждением, выполняющим междисциплинарные
комплексные исследования озера Байкал и других водоемов Сибири. Основное
научное направление деятельности Института - "Лимнология: механизмы
образования, биоразнообразие, эволюция, современное состояние и прогноз
развития водоемов и водотоков суши".
